不会，恢复出厂设置只是擦除手机数据，不会影响系统。请记住在恢复出厂设置之前进行备份，以免丢失重要数据。备份方法如下:
1)打开设置，进入其他高级设置——备份和复位；
2)点击进入【本地备份】；
3)点击【新建备份】，选择要备份的内容；
4)单击开始备份，等待备份完成。
红米not
1.手机解锁进入系统后，点击手机的设置图标进入。
2.在设置列表中向下滑动，找到要输入的其他设置。
3.进入后，在页面中选择恢复手机的选项。
4.点击后需要验证手机锁屏密码。验证后，单击选项以完全清除所有数据。
5.在弹出窗口中，单击清除数据选项。
6.在是否继续清除手机所有数据的窗口中，再次点击清除数据。
7.点击后手机会自动重启并清空所有数据。清除数据后，手机可以恢复出厂设置。
打开备份应用程序并恢复它。如果之前已经同步过小米云服务，则恢复登录账号——如果红米没有云备份应用，则无法恢复应用，只能恢复联系人消息等重要数据。
1.选择"系统与安全"界面中的选项。2.打开"系统和安全选项，我们将继续选择"备份"选项。
3.选择"备份"选项，将提示您需要备份哪些材料。如果需要备份以下资料，需要选择。选择成功后，可以备份。选择"开始备份这个时候。
4.选择"开始备份，系统会自动启动备份，并在此过程中保持我们的手机充电。同时可以让手机保持一个恒定的屏幕状态。
5.如果您需要在备份过程中停止备份您自己的数据，您可以选择"停止备份界面底部的选项。
6.备份成功后，系统会提示您备份成功，您可以放心升级或刷新您的系统。
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